Como comercio, ¿puedo aceptar los recs sólo para un porcentaje de mis ventas?

Sí, la idea es que una parte de tus ingresos por ventas sean en recs. Si el 100% de tus ventas son en euros, no estás formando parte en la red del rec y no disfrutas de sus beneficios. Por otro lado, si el 100% de sus ventas son en recs, puede ser que dificulte tus obligaciones para el pago impuestos en euros.